La Tour de l’horloge date du XIVe siècle. Elle faisait partie de l’enceinte fortifiée qui isolait la vie monastique du reste du monde, comme en témoignent encore les mâchicoulis, sur les murs extérieurs. De cette enceinte, ne subsiste qu’un pan de mur externe, entre la Tour de l’Horloge et la Maison du Prieur. Plusieurs bâtiments s’y adossent, dont la Maison de la Dîme et la Tour Saint-Georges.
La Tour de l’Horloge abrite la plus vieille cloche datée du Canton de Vaud, fondue en 1396. Son clocheton du XVIIIe siècle a fait l’objet d’importants travaux de rénovation, en 2023.